
사업을 하다 보면 세금계산서라는 녀석이 친구처럼 늘 곁을 지키지만 때로는 골칫거리로 변하기도 합니다. 분명 제대로 발급했다고 생각했는데 거래처에서 “이거 날짜가 잘못됐어요”라든지, “금액이 달라요”라는 연락을 받으면 순간 당황하게 되죠. 저도 처음에는 “이걸 도대체 어디서 취소해야 하지?” 하며 홈택스 화면을 몇 바퀴나 돌았던 기억이 있습니다. 오늘은 그런 당황스러운 상황을 조금이라도 덜어드리기 위해 홈택스에서 세금계산서를 취소하는 방법을 알려드리고자 합니다.
세금계산서 취소가 필요한 순간
세금계산서를 발급하고 나서 거래가 성사되지 않거나, 금액이나 공급가액을 잘못 입력하는 실수는 흔히 일어납니다. 저 같은 경우에는 거래처에서 요청한 날짜와 실제 발급일을 혼동해서 발행한 적이 있었는데요. 이런 경우에는 단순 정정으로는 해결이 안 되고 반드시 취소 후 재발행을 해야 합니다. 세금계산서라는 것이 국세청에 바로 신고되는 자료다 보니, 제대로 정리하지 않으면 나중에 부가세 신고 때 불이익을 받을 수 있습니다. 그렇기 때문에 취소 시점과 방법을 정확히 아는 게 중요합니다.
홈택스에서 세금계산서 취소, 이렇게 해야 합니다
저도 처음엔 “취소 버튼 하나만 누르면 끝나겠지”라고 생각했는데요. 실제로는 그렇지 않더라고요. 홈택스에서 발급한 세금계산서를 취소하려면 단순하게 삭제하는 것이 아니라 ‘수정 세금계산서’를 발급해야 합니다. 그래야 국세청 전산에 ‘이 거래는 무효 처리되었다’는 기록이 남고, 거래처에도 제대로 취소 내역이 전달됩니다.
취소 절차, 차근차근 따라가기

- 홈택스 로그인
공동인증서나 간편인증으로 로그인합니다. 사업자 등록번호로 들어가야 세금계산서 메뉴 이용이 가능합니다. - 전자세금계산서 메뉴 선택
상단 메뉴에서 전자세금계산서 → 발급/조회로 들어갑니다. - 취소할 세금계산서 조회
발급 목록에서 거래처명, 발급일자, 금액 등을 기준으로 취소할 세금계산서를 찾아 클릭합니다. - 수정발급 선택
화면 우측 하단에 있는 [수정발급] 버튼을 누릅니다. 여기서 중요한 건, 단순 정정이 아니라 취소 사유를 선택하는 겁니다. 보통 “계약 해제”나 “발급 착오” 같은 사유가 해당됩니다. - 마이너스(-) 세금계산서 입력
원 세금계산서와 동일한 내용으로 입력하되, **공급가액과 세액을 모두 마이너스(-)**로 작성합니다. 이렇게 하면 원 세금계산서가 상쇄되어 ‘취소’ 처리되는 거죠. - 발급 완료 후 확인
발급 내역에서 보면 원본 세금계산서와 함께 취소용 수정세금계산서가 나란히 표시됩니다. 이 상태가 되어야 제대로 취소가 끝난 겁니다.
구분 | 주의사항 | 이유 |
---|---|---|
취소 시점 | 가급적 같은 달 안에 처리 | 부가세 신고 시 혼선 방지 |
거래처 소통 | 취소 전 반드시 안내 | 상대방 회계 처리 혼란 예방 |
증빙 보관 | 취소 세금계산서 PDF 저장 | 세무조사 대비 및 기록 보관 |
취소 시 유의사항은 위와 같습니다.
거래처와의 소통도 필수

세금계산서를 취소할 때는 거래처에도 반드시 알려줘야 합니다. 제가 한 번은 거래처에 말도 안 하고 취소만 해버렸다가, 상대방이 회계 처리 중에 “왜 세금계산서가 사라졌냐”라며 연락이 온 적이 있었습니다. 홈택스에서 취소해도 상대방 홈택스에도 그대로 반영되기 때문에, 미리 양해를 구하고 재발행까지 진행하는 게 신뢰를 지키는 방법입니다.
홈택스에서 취소 세금계산서 발행 후 확인하는 법
취소가 제대로 되었는지 확인하는 방법도 있습니다.
- 전자세금계산서 → 발급/조회 → 발급내역에 들어가면, 취소된 세금계산서 옆에 “취소” 표시가 뜹니다.
- 원본 세금계산서와 나란히 취소 건이 표시되기 때문에, 이중 확인이 가능합니다.
- 필요하다면 취소 세금계산서 PDF를 저장해 두는 것도 좋습니다. 나중에 세무대리인에게 자료 제출할 때 도움이 됩니다.
마치며
단계 | 진행 내용 | 화면 위치/버튼 |
---|---|---|
1단계 | 로그인 | 공동/간편 인증서 |
2단계 | 전자세금계산서 메뉴 진입 | 상단 메뉴 → 전자세금계산서 |
3단계 | 발급 내역 조회 | 발급/조회 클릭 → 목록 검색 |
4단계 | 수정발급 선택 | 세금계산서 클릭 후 [수정발급] |
5단계 | 마이너스(-) 처리 | 공급가액/세액 입력 시 음수(-) 기재 |
6단계 | 발급 완료 | 발급 내역에서 취소 여부 확인 |
홈택스 세금계산서 취소 방법을 요약하자면 위와 같습니다. 수정 세금계산서 발급은 겉보기엔 복잡해 보이지만 사실 “발급 내역에서 선택 → 수정발급 → 마이너스 처리”라는 단순한 구조입니다. 몇 번 해보면 오히려 실수했을 때 대처하는 법이 몸에 배어 마음이 한결 편해지죠. 중요한 건 취소 사유를 명확히 하고, 거래처와도 소통하면서 처리하는 것입니다. 이렇게 해두면 세무신고 과정에서도 깔끔하게 정리되고 불필요한 오해도 줄일 수 있습니다. 혹시 지금 바로 잘못 발급한 세금계산서가 있다면 당황하지 말고 홈택스에서 ‘수정발급’을 눌러 마이너스(-) 세금계산서를 발행해 보세요.